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海关总署于2012年开始建设金关工程二期，工程总投资为34.2亿元，项目于2018年2月份验收。金关二期项目关对加工贸易管理体系进行了升级，包括金关二期加工贸易账册系统与金关二期加工贸易手册系统。其中帐册系统主要针对中大型加工贸易企业，实行“料号级管理、分段式核销”的新型监管模式，业务模式既满足企业生产经营管理的实际需要，也符合海关实际监管的要求；在提高企业运作效率的同时，有效降低海关执法风险。
云关通金关二期电子账册软件系统团队温馨提醒：金关二期帐册系统与原联网简短电子帐册的区别是：
金关二期帐册系统新增了核注清单这一功能模块，而核注清单是指：
1、所有通关必须先申报核注清单；
2、核注清单中料件、成品全部使用料号级申报；
3、不涉证、不涉税、不涉贸易统计的核注清单可不生成报关单；
4、涉证、涉税、涉贸易统计的核注清单可归并生成报关单；
5、一份核注清单对应一份报关单；
报关单成功审结后，核注清单参与海关底帐核扣计算。
云关通金关二期电子账册软件系统及风险管控系统，提供整套金关二期账册软件系统及辅导上线服务。尤其是符合金二要求的风险管控软件系统和核查分析系统，满足了企业内部管理提升与海关管理的要求。
同时，云关通关务管理专家也会安排《金关二期新监管帐册业务解析及关务风险管控》相关专题沙龙辅导课程活动，结合云关通近20年关务领域积累，及近期辅导企业试点金关二期帐册的经验与方法，确保企业成功顺利上线及后续问答解答服务。申请体验/使用云关通金关二期电子账册软件系统及风险管控系统，并获得云关通关务专家整套金关二期关务软件系统及辅导上线服务+课程辅导VIP门票（全国帮助热线：0769-22384204，微信waytogo888，在线QQ3256375024）