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海关总署于2012年开始建设金关工程二期，工程总投资为34.2亿元，项目于2018年2月份验收。金关二期项目关对加工贸易管理体系进行了升级，包括金关二期加工贸易账册系统与金关二期加工贸易手册系统。其中帐册系统主要针对中大型加工贸易企业，实行“料号级管理、分段式核销”的新型监管模式，业务模式既满足企业生产经营管理的实际需要，也符合海关实际监管的要求；在提高企业运作效率的同时，有效降低海关执法风险。
云关通金关二期账册软件系统团队温馨提醒，新的金关二期加工贸易系统有四大特点：
1、底帐类型整合：由原有的海关的27种底账整合为5种，分别是来料加工手册、进料加工手册、电子账册、保税物流账册、设备账册。这样全国统一了模式和系统，更方便管理；
2、料号级管理：一直以来海关与企业都用项号级商品与平均单耗管理，导致企业管理与海关核查两者之间存在天然差异，所以金关二期全面引入了料号级，旨在减少两者之间因核算导致产生的差异。
3、核注清单管理：金关二期系统中启用了新的核注清单，采用料号级申报，可转换生成报关单通关，使用核注清单进行帐册核销。
4、智能化审核：金关二期系统上线后，海关对企业的通关与核查全部使用电脑大数据分析、智能化的审核，确保海关监管的有效性。
云关通金关二期账册软件系统及风险管控系统，提供整套金关二期电子账册软件系统及辅导上线服务。尤其是符合金二要求的风险管控软件系统和核查分析系统，满足了企业内部管理提升与海关管理的要求。
云关通关务管理专家也会安排《金关二期新监管帐册业务解析及关务风险管控》相关专题沙龙辅导课程活动，结合云关通近20年关务领域积累，及近期辅导企业试点金关二期帐册的经验与方法，确保企业成功顺利上线及后续问答解答服务。
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