2021年海关发布《海关注册登记和备案企业信用管理办法》（总署令251号），2022年发布新的《海关高级认证企业标准》（海关总署第106号公告），明确指出AEO高级认证企业必须建立对进出口活动的内部审计制度并有效落实，要求企业每年实施1次以上的内部审计并建立书面或者电子资料的档案。已成为AEO高级认证企业的，应当每年对持续符合海关高级认证企业标准实施内部审计。
所谓内审，就是审核企业进出口业务管理流程设置是否合理、完备，涉及的货物流、单证流、信息流是否可有效控制。内容涉及面广、涉及部门众多，对内审人员专业度要求高，它是AEO认证过程中最困难的操作项目之一，但却是必备的不可缺少的重要环节，若不能通过，对AEO来讲几乎是一票否决！
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